Czym są zestawy do PCR i jak można je wykorzystać?

2 min czytania
Aktualności
Czym są zestawy do PCR i jak można je wykorzystać?

Podstawowe informacje na temat PCR/zestawów do PCR

Łańcuchowa reakcja polimerazy (PCR) jest reakcją biochemiczną, w wyniku której dochodzi do amplifikacji pojedynczej cząsteczki DNA i, w efekcie powtarzania poszczególnych etapów, do wytworzenia milionów kopii w bardzo krótkim czasie.

Synteza DNA zachodzi w trzech głównych etapach:

  1. denaturacja jest to proces, w którym podwójna nić DNA jest rozdzielana na pojedyncze nici pod wpływem ogrzewania;
  2. przyłączanie starterów, w tym kroku potrzebne są startery, czyli krótkie syntetyzowane oligonukleotydy DNA, które wiążą się z docelowym locus DNA;
  3. wydłużanie łańcucha, na tym etapie polimeraza DNA Taq wydłuża odpowiedni koniec 3’ startera zgodnie z nicią szablonu i tworzy podwójną nić DNA.

Ponieważ PCR jest bardzo złożoną i wymagającą reakcją, obecnie są dostępne komercyjne, gotowe do użycia zestawy do PCR w przystępnej cenie do badań naukowych lub diagnostyki medycznej. Zestawy do PCR są zoptymalizowane pod kątem określonych warunków, co pomaga badaczom w redukcji pipetowania i ryzyka zanieczyszczenia, jak również oszczędzają czas, dozowanie, możliwe zmiany i błędy w pojedynczej reakcji PCR, zestawy do PCR stają się idealnym rozwiązaniem w aplikacjach o wysokiej wydajności i testach diagnostycznych.

Czym są odczynniki PCR?

Zestawy do PCR, znane również jako PCR master mix, super mix lub ready mix, stanowią mieszaninę odczynników do PCR. Zestaw do PCR zazwyczaj składa się z polimerazy DNA, dNTP, kofaktorów (MgCl2), starterów, dNTP i zoptymalizowanego buforu lub innych dodatkowych odczynników w optymalnych stężeniach, które można ze sobą mieszać. Jego określona objętość może być rozdzielona pomiędzy probówki PCR, paski lub płytki i dodana do szablonu DNA w zależności od zastosowania. Zestaw do PCR może służyć jako bardzo użyteczne narzędzie w takich zastosowaniach jak: amplifikacja szablonu DNA do sekwencjonowania i klonowania, mutageneza, generowanie bibliotek, profilowanie ekspresji genów i amplifikacja kilku genów/fragmentów jednocześnie.

Jaka polimeraza jest używana do PCR?

Jednym z kluczowych składników zestawów do PCR jest polimeraza DNA. Polimeraza DNA powszechnie stosowana w zestawach do PCR jest wyizolowana z termofilnej bakterii Thermus aquaticus polimeraza Taq. Różne modyfikacje genetyczne polimerazy Taq, w tym polimerazy DNA typu hot-start, polimerazy DNA o odwrotnej transkrypcji, stwarzają podstawy do zastosowania zestawów do PCR w obszarach naukowo-badawczych oraz zwiększają możliwości zastosowania zestawów PCR w diagnostyce medycznej.

Większość dostępnych komercyjnych zestawów do PCR zawierających zmodyfikowaną polimerazę DNA przeznaczona jest do określonego typu PCR dostosowanego do określonego typu termocyklera. Jako przykład można podać PCR w czasie rzeczywistym (znany również jako ilościowy PCR lub qPCR).

Co można zrobić za pomocą PCR?

Powszechne zestawy do PCR znajdują zastosowanie w:

– rutynowych PCR do amplifikacji i klonowania;
– kolonijnych PCR;
– zagnieżdżonych PCR;
– PCR o wysokiej wydajności w genotypowaniu lub diagnostyce;
– multipleks PCR;
– sekwencjonowaniu nowej generacji (NGS);
– qPCR;
– RT-qPCR;
– jednoetapowych PCR;
– Droplet PCR.

Komentarze

Oceń artykuł

Średnia ocen: 5 / 5. Ilość głosów: 1

Bądź pierwszym, który oceni wpis

717 artykułów

O autorze

Sekretarz redakcji, redaktor, specjalista ds. marketingu, reklamy i promocji. Koordynator wydawnictwa Ogólnopolskiej Gazety oraz Portalu Pielęgniarek i Położnych.
Artykuły
Zobacz także
AktualnościOferty pracy

Praca dla pielęgniarki. Wymagana znajomość j. obcego. Do 100 zł/godz.

1 min czytania
Oferta pracy dla pielęgniarki Poszukiwana wykwalifikowana pielęgniarka do pracy w rozwijającej się dziedzinie telemedycyny. Praca polega na zdalnym udzielaniu konsultacji zdrowotnych oraz…
Aktualności

Nowe torby bawełniane dla pielęgniarek.

1 min czytania
Torby idealne dla pielęgniarek, lekarzy, ratowników medycznych i innych członków personelu medycznego! Niezwykle praktyczne, stylowe i przyjazne dla środowiska – torby bawełniane…
AktualnościNowa siatka płacOdszkodowania dla pielęgniarek LMPielęgniarki z mgr pozywają szpitale

Prezes izby pielęgniarek odegrała rolę „dobrej cioci”.

7 min czytania
Dlaczego prezes pielęgniarek tego nie powiedziała? Bo dobrze wie, że wyszłaby na hipokrytę i obłudnika… Sprawa konfliktu płacowego, dotyczącego grupy zawodowej pielęgniarek…
Komentarze
×
AktualnościNowa siatka płac

Siatka płac pielęgniarek autorstwa związku OZZPiP.